La originada por una alteración del sistema inmunitario en el que éste ataca al propio organismo. En este caso, el sistema inmunitario se convierte en el agresor y ataca a partes del cuerpo en vez de protegerlo. Existe una respuesta inmune exagerada contra sustancias y tejidos que normalmente están presentes en el cuerpo.
Específicas de órgano
- Anemia perniciosa
- Atrofia gástrica
- Celiaquía
- Cirrosis biliar primaria
- Colangitis esclerosante primaria
- Colitis ulcerosa
- Diabetes mellitus tipo 1
- Enfermedad celíaca
- Enfermedad de Crohn
- Enfermedad de Graves
- Hepatitis autoinmune
- Miastenia de Lambert-Eaton
- Miastenia gravis
- Mixedema primario
- Neuropatías
- Oftalmía simpática
- Pénfigo vulgar
- Síndrome de Goodpasture
- Síndrome de Miller-Fisher
- Tiroiditis de Hashimoto
- Uveítis
Multiorgánicas o sistémicas
- Artritis reumatoide
- Algunas dermatitis
- Enfermedad de Behçet
- Esclerodermia
- Esclerosis lateral amiotrófica
- Esclerosis múltiple y su variedad enfermedad de Devic
- Espondiloartropatía
- Fibromialgia
- Fiebre reumática
- Granulomatosis de Wegener
- Lupus eritematoso sistémico
- Síndrome antifosfolípidos o síndrome de Hughes
- Polimiositis y dermatomiositis
- Polirradiculoneuropatía desmielinizante inflamatoria crónica
- Psoriasis
- Púrpura trombocitopénica inmune
- Sarcoidosis
- Síndrome de fatiga crónica
- Síndrome de Guillain-Barré
- Síndrome de Sjögren
- Vasculitis sistémica
- Vitíligo